L'éclaircissage est une pratique nécessaire en agroforesterie et dans l'approche jardin forêt. Les agriculteurs appliquent cette technique dans quelques zones de leur jardin forêt pour s'assurer qu'ils consacrent leur temps précieux, leur eau et leur travail à des plantes saines qui fleuriront.
 
Le besoin d'éclaircissage commence en pépinière lors de la propagation des semences. Les agriculteurs sèment plusieurs graines dans un sac d'arbre ou sèment des lits à racines nues plus densément que nécessaire, car il y aura des graines que ne germeront pas. Dans de nombreux cas, plus d'une semence germera dans un sac ou le lit sera surpeuplé. Étant donné qu'une seule plantule doit être cultivée dans chaque sac, les agriculteurs doivent examiner et déterminer quelle plantule semble la plus forte, en enlevant les autres plantules moins vigoureuses. S'ils semblent tous en bonne santé, l'agriculteur peut également transplanter ces autres plantules dans un autre sac. Avec les lits à racines nues, les semis rabougris peuvent être éliminés tandis que les plantules saines peuvent être transplantées pour assurer un écartement adéquat entre chaque plantule.
 
Cette compétition des ressources peut également se produire dans les haies ou les allées vivantes, en particulier celles qui sont densément plantées par semis direct, il est donc important que les agriculteurs surveillent la croissance initiale et s'assurent qu'il n'y a pas de surpeuplement. De plus, un agriculteur peut éventuellement avoir besoin d'éclaircir certains des arbres les plus âgés d'un système de culture en allées s'ils deviennent trop grands et que leurs canopées commencent à se chevaucher ou à empêcher les cultures entre les allées d'obtenir la lumière du soleil dont elles ont besoin.