La considération la plus importante lors de la sélection d'un porte-greffe est de s'assurer que le porte-greffe est compatible avec le greffon, ce qui signifie qu'ils appartiennent à la même famille botanique. Le porte-greffe d'une greffe déterminera des caractéristiques telles que la forme de croissance des racines, la résistance des racines aux maladies et à la sécheresse ainsi qu'aux attaques d'insectes et la vigueur de l'arbre. Il est donc important pour les agriculteurs d'utiliser des variétés fortes adaptées à l'environment local.

Il est recommandé que lorsque les agriculteurs sélectionnent un semis de porte-greffe dans une pépinière, ils sélectionnent les semis les plus sains et les plus vigoureux. La plantule doit avoir un diamètre de 1 cm à mi-hauteur de sa tige.